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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Biologie Epidémiologie et Analyse de Risque en santé animale

BIOEPAR - http://www6.angers-nantes.inra.fr/bioepar

ATOM

Automatiser la chaîne logicielle du modèle épidémiologique à l’outil d’aide à la décision

Le projet ATOM (Automation of decision support Tools based On epidemiological Models) est financé par la Direction Partenariat & Transfert pour l’Innovation (DPTI) d’INRAE. Il vise à développer un processus d’industrialisation de la génération d’outils d’aide à la décision (OAD) à partir de modèles épidémiologiques mécanistes.

Produire des outils d’aide à la décision (OAD) pour les gestionnaires de la santé est un enjeu crucial de valorisation des recherches interdisciplinaires menées en épidémiologie prédictive. Ces recherches visent à mieux comprendre, anticiper, et faciliter la gestion des maladies infectieuses animales et des risques de santé publique vétérinaire associés. Une nouvelle approche de modélisation générique (EMULSION), s’appuyant sur des méthodes de l’Intelligence Artificielle, facilite dès à présent la co-construction de modèles épidémiologiques entre modélisateurs, scientifiques d’autres disciplines, et gestionnaires de la santé, et simplifiant la révision et le maintien des codes. Néanmoins, les modèles de recherche restent en général difficilement exploitables en autonomie par des non-modélisateurs.

L’objectif du projet ATOM est d’élaborer une chaîne logicielle permettant de générer automatiquement des prototypes d’OAD à partir des modèles épidémiologiques décrits dans EMULSION et accompagnés de spécifications complémentaires concernant les paramètres, données d’entrée, scénarios à comparer et sorties d’intérêt (épidémiologiques, démographiques, économiques) souhaités. Ces prototypes peuvent ensuite faire l’objet d’une déclinaison à façon selon les besoins spécifiques des utilisateur finaux, et ainsi contribuer à renforcer un continuum entre recherche académique et innovation en santé animale.

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