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Étudiant en thèse de bioinformatique je me suis intéressé aux gènes dupliqués chez le pommier.

• Thématique de recherche

Evolution des gènes dupliqués chez le pommier

• Compétences générales

Environnement de développement et bonne pratique :
  -  Versionning
  -  FAIR data
  -  CI/CD
  -  Docker
  -  Linux

Langages de programmation :
  -  Python 3
  -  Snakemake
  -  Regular expressions
  -  Shell
  -  CSS3 & HTML5
  -  SQL, PL/SQL
  -  PHP
  -  JavaScript (ES5-6, D3.js)
  -  R
  -  Markup Language (LATEX, Markdown, Hugo)
  -  C/C++

Outils bioinformatiques (i-ADHoRe, PAML, analyses différentielles RNA-Seq)
Analyses statistiques
Visualisation de données (d3.js, circos, visualisation avec Python (seaborn, matplotlib, altaïr))

• Pages web

GitHub 
LinkedIn 
Research Gate 
Scholar

• Publications

Tanguy Lallemand, Sebastien Aubourg, Gilles Hunault, Jean-Marc Celton, and Claudine Landès. Evolution of ohnologous chromosomes following Whole Genome Duplication in apple. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique. Poster. Sept. 2020.

url: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02928930.

Tanguy Lallemand, Martin Leduc, Claudine Landès, Carène Rizzon, and Emmanuelle Lerat. “An Overview of Duplicated Gene Detection Methods: Why the Duplication Mechanism Has to Be Accounted for in Their Choice”. In: Genes (2020). doi:10.3390/genes11091046.

url: http://doi.org/10.3390/genes11091046.

Tanguy Lallemand, Sylvain Gaillard, Sandra Pelletier, Claudine Landès, Sébastien Aubourg, and Julie Bourbeillon. Visualizing metadata change in networks and/or clusters. 2019.