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2020

  • Adams K, Araújo W, Aubourg S, Baginsky S, Bakker E, Bärenfaller K, Batley J, Beale M, Beilstein M, Belkhadir Y, Mendel G, Berardini T, Bergelson J, Blanco‐herrera F, Brady S, Braun HP, Briggs S, Brownfield L, Cardarelli M, Castellanos‐uribe M, Coruzzi G, Dassanayake M, de Jaeger G, Dilkes B, Doherty C, Ecker J, Edger P, Edwards D, El Kasmi F, Eriksson M, Exposito‐alonso M, Falter‐braun P, Fernie A, Ferro M, Fiehn O, Friesner J, Greenham K, Guo Y, Hamann T, Hancock A, Hauser MT, Heazlewood J, Ho CH, Hõrak H, Huala E, Hwang I, Iuchi S, Jaiswal P, Jakobson L, Jiang Y, Jiao Y, Jones A, Kadota Y, Khurana J, Kliebenstein D, Knee E, Kobayashi M, Koch M, Krouk G, Larson T, Last R, Lepiniec L, Li S, Lurin C, Lysak M, Maere S, Malinowski R, Maumus F, May S, Mayer K, Mendoza‐cozatl D, Mendoza‐poudereux I, Micol JL, Millar H, Mock HP, Mukhtar K, Mukhtar S, Murcha M, Nakagami H, Nakamura Y, Nicolov L, Nikolau B, Nowack M, Nunes‐nesi A, Palmgren M, Parry G, Patron N, Peck S, Pedmale U, Perrot‐rechenmann C, Pieruschka R, Pío‐beltrán J, Pires JC, Provart N, Rajjou L, Reiser L, Rhee S, Rigas S, Rolland N, Romanowski A, Savaldi‐goldstein S, Schmitz R, Schulze W, Seki M, Shimizu K, Slotkin K, Small I, Somers D, Sozzani R, Spillane C, Srinivasan R, Taylor N, Tello‐ruiz MK, Thelen J, Tohge T, Town C, Toyoda T, Uzilday B, Walley J, Ware D, Weckwerth W, Whitelegge J, Wienkoop S, Wright C, Wrzaczek M, Yamazaki M, Yanovsky M, Žárský V, Zhong X, Peer Y, Wijk K, Gillhaussen P (2020) Current status of the multinational Arabidopsis community. Plant Direct.4 (7), e00248
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2019

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  • N'Guyen GQ, Raulo R, Marchi M, Agustí-Brisach C, Iacomi B, Pelletier S, Renou JP, Bataillé-Simoneau N, Campion C, Bastide F, Hamon B, Mouchès C, Porcheron B, Lemoine R, Kwasiborski A, Simoneau P, Guillemette T. (2019) Responses to Hydric Stress in the Seed-Borne Necrotrophic Fungus Alternaria brassicicola. Frontiers in Microbiollogy. 30;10:1969
  • Pelletier S, Gully K, Guillou M-C, Ferrand M, Aligon S, Pokotylo I, Perrin A, Vergne E, Fagard M, Ruelland E, Grappin P, Bucher E, Renou J-P, Aubourg S (2019) The SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana. Journal of Exp Botany. 70(4)
  • Torres-Cortés G, Garcia BJ, Compant S, Rezki S, Jones P, Préveaux A, Briand M4, Roulet A5, Bouchez O5, Jacobson D2, Barret M4. (2019) Differences in resource use lead to coexistence of seed-transmitted microbial populations. Sci Rep. 9:e6648
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2018

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  • Berthelier J, Casse N, Daccord N, Jamilloux V, Saint-Jean B, Carrier G (2018) A transposable element annotation pipeline and expression analysis reveal potentially active elements in the microalga Tisochrysis lutea. BMC Genomics. 19(1):378
  • Chen NWG, Serres-Giardi L, Ruh M, Briand M, Bonneau S, Darrasse A, Barbe V, Gagnevin L, Koebnik R, Jacques M-A (2018) Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean. BMC Genomics. 19:606
  • Dall'Agata M, Pagliarani G, Padmarasu S, Troggio M, Bianco L, Dapena E, Miñarro M, Aubourg S, Lespinasse Y, Durel C-E, Tartarini S (2018) Identification of candidate genes at the Dp-fl locus conferring resistance against the rosy apple aphid Dysaphis plantaginea. Tree Genetics & Genomes. 14:12
  • Hibrand Saint-Oyant L, Ruttink T, Hamama L, Kirov I, Lakhwani D, Zhou NN, Bourke PM, Daccord N, Leus L, Schulz D, Van de Geest H, Hesselink T, Van Laere K, Debray K, Balzergue S, Thouroude T, Chastellier A, Jeauffre J, Voisine L, Gaillard S, Borm TJA, Arens P, Voorrips RE, Maliepaard C, Neu E, Linde M, Le Paslier MC, Bérard A, Bounon R, Clotault J, Choisne N, Quesneville H, Kawamura K, Aubourg S, Sakr S, Smulders MJM, Schijlen E, Bucher E, Debener T, De Riek J, Foucher F (2018) A high-quality genome sequence of Rosa chinensis to elucidate ornamental traits. Nature Plants. 4:473-484
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2017

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  • Urrestarazu J, Muranty H, Denancé C, Leforestier D, Ravon E, Guyader A, Guisnel R, Feugey L, Aubourg S, Celton J-M, Daccord N, Dondini L, Gregori R, Lateur M, Houben P, Ordidge M, Paprstein F, Sedlak J, Nybom H, Garkava-Gustavson L, Troggio M, Bianco L, Velasco R, Poncet C, Theron A, Moriya S, Bink M, Laurens F, Tartarini S, Durel C-E (2017) Genome-wide association mapping of flowering and ripening periods in apple. Frontiers in Plant Science. 8:1923.

2016

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  • Cunty A, Cesbron S, Briand M, Carrère S, Poliakoff  F, Jacques MA, Manceau C (2016) Draft genome sequences of five Pseudomonas syringae  pv. actinidifoliorum strains isolated in France. Brazilian Journal of Microbiology. 47(3):529-30
  • Dheilly E, Gall SL, Guillou MC, Renou JP, Bonnin E, Orsel M, Lahaye M (2016) Cell wall dynamics during apple development and storage involves hemicellulose modifications and related expressed genes. BMC Plant Biol. 16(1):201
  • Jacques M-A, Denancé N, Legendre B, Morel E, Briand M, Mississipi S, Durand K, Olivier V, Portier P, Poliakoff F, Crouzillat D (2016) New variants of coffee-infecting Xylella fastidiosa issued from homologous recombination. Appl. Environ. Microbiol. 82:1556-1568.
  • Legeay M, Duval B, Renou J-P (2016) Inference and differential analysis of extended core networks : a way to study anti-sense regulation. IEEE International conference in Bioinformatics and Biomedecine. BIBM 15-18/12/2016
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  • Liorzou M, Pernet A, Li S, Chastellier A, Thouroude T, Michel G, Malécot V, Gaillard S, Briée C, Foucher F, Oghina-Pavie C, Clotault J, Grapin A (2016) Nineteenth century French rosee (Rosa sp) germplasm shows a shift over time from a European to an Asian genetic background. Journal of Exp. Botany. 67(15):4711-25
  • Rezki S, Campion C, Iacomi-Vasilescu B, Préveaux A, Toualbia Y, Bonneau S, Briand M, Laurent E, Hunault G, Simoneau P, Jacques MA, Barret M (2016) Differences in stability of seed-associated microbial assemblages in response to invasion by phytopathogenic microorganisms. PeerJ. 4:e1923
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2015

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  • Celton JM, Dheilly E, Guillou MC, Simonneau F, Juchaux M, Costes E, Laurens F, Renou JP. 2014. Additional amphivasal bundles in pedicel pith exacerbate central fruit dominance and induce self-thinning of lateral fruitlets in apple. Plant Physiology.Apr;164(4):1930-51
  • Celton JM, Gaillard S, Bruneau M, Pelletier S, Aubourg S, Martin-Magniette ML, Navarro L, Laurens F, Renou JP. 2014. Widespread anti-sense transcription in apple is correlated with siRNA production and indicates a large potential for transcriptional and/or post-transcriptional control. New Phytolologist. Jul; 203(1):287-99
  • Doustaly F., Combes F., Fiévet J, Berthet S., Hugouvieux V., Bastien O., Aranjuelo I., Leonhardt N., Rivasseau C., Carrière M., Vavasseur A., Renou J.P., Vandenbrouck Y. & Bourguignon J. 2014. Uranium perturbs signaling and iron uptake response in Arabidopsis thaliana roots. Metallomics. Mar 26;6(4):809-21
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