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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Thématiques

Nos activités de recherche s'organisent autour de deux grands axes.

  1. L'identification de phytocytokines impliquées dans le contrôle du développement de la plante et/ou dans les mécanismes de contrôle des défenses avec l'objectif de découvrir des outils de biocontrôle.
  2. La compréhension de la dynamique évolutive des familles de gènes dans les génomes de rosacées en incluant le rôle des éléments transposables et l'épigénétique dans l'expansion des familles de gènes et/ou l'adaptation des plantes aux stress environnementaux.

Parallèlement, notre équipe assure un soutien bioinformatique à l’unité :

  • administration de l’infrastructure de stockage et de calcul scientifique de l’unité,
  • développement de bases de données pour gérer les métadonnées des expériences et des cultures réalisées à l’IRHS,
  • implémentation de méthodes d’analyse et de visualisation des données à grande échelle
  • développement de nouveaux outils pour réaliser des méta-analyses,
  • soutien technique pour l’utilisation des serveurs,
  • expertise pour les analyses génomiques et/ou transcriptomiques.

Evolution des gènes dupliqués chez les Rosoideae

Comprendre l'influence des mécanismes de duplications grâce à une famille présentant une grande diversité génétique.
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Caractérisation fonctionnelle d’une nouvelle famille de peptides sécrétés impliquée dans la régulation des voies de défense et de développement chez Arabidopsis thaliana.

Le peptide SCOOP12, aux frontières des réponses de défense aux pathogènes et du développement racinaire.
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Evolution des gènes dupliqués chez le pommier

Malus domestica a une WGD récente et bien conservée. Cet événement massif fait du pommier un organisme de choix pour étudier les gènes dupliqués.
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