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Les organismes de quarantaine sont des organismes pathogènes ou ravageurs des plantes, absents ou présents en populations contrôlées, sur le territoire Européen. Ces organismes sont susceptibles de provoquer des dégâts considérables à l’agriculture. De fait, un contrôle efficace des populations et des mouvements de ces organismes de quarantaine est indispensable pour la protection des végétaux.
Afin d’obtenir des outils et des connaissances permettant ce suivi, il est nécessaire d’avoir accès à du matériel de référence, bien identifié et accessible.
Si l’accès à du matériel fiable et bien conservé est facile en Europe pour ce qui concerne les bactéries et les champignons, la situation est nettement plus compliquée et floue pour les virus, phytoplasmes, nématodes, insectes, ainsi que pour les plantes invasives.

L’objectif du projet Q-Collect est de réunir les diverses collections européennes détenant des organismes de quarantaine afin de faire le bilan des ressources disponibles, des manques, et in-fine d’améliorer l’organisation au niveau européen afin de permettre aux scientifiques d’avoir accès à ce matériel.

Ce projet est dirigé par Peter Bonant du Plant Research International de Wageningen (Pays-bas) et rassemble 16 partenaires, dont l’INRA et l’ANSES ainsi que l’OEPP (Organisation Européenne de Protection des Plantes).

L'unité participe activement à ce projet, notamment via la Collection Française de Bactéries associées aux Plantes (CIRM-CFBP), hébergée dans l’équipe EmerSys de l’IRHS. Le CIRM-CFBP est notamment responsable du work-package qui s’occupe d’améliorer l’accès aux ressources, et de part son organisation fait partie des collections qui servent de « modèle » pour améliorer la recherche portant sur les organismes de quarantaine.