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Les études des déterminants épidémiologiques et de l’interaction plante-pathogène dans le cas des maladies fongiques transmises par les semences de carottes sont réalisées sur différentes espèces pathogènes :

Alternaria dauci : l’agent de la brûlure foliaire est responsable de la maladie aérienne la plus préjudiciable sur carotte. Les déterminants de l’interaction entre A. dauci et sa plante-hôte sont étudiés en collaboration avec l’équipe QuaRVeg. Concernant notre équipe, les travaux sur ce pathosystème comprennent différents volets :

• -la caractérisation des composantes du pouvoir pathogène d’A. dauci (spectre d’hôte, agressivité), l’analyse de sa diversité [Boedo et al. 2012] et l’effet de l’interaction variété × isolat dans la résistance quantitative de la plante [le Clerc et al. 2015]
•  -le rôle de métabolites secondaires toxiques produits par chaque partenaire au cours de l’interaction :
  • implication de composés de défense de la carotte (6-méthoxymélléine, falcarindiol) dans la résistance partielle de la carotte [Lecomte et al. 2012]
  • caractérisation de toxines fongiques et de leur lien avec la résistance de la plante [Lecomte et al. 2014, J. Courtial  Thèse en cours]

Diaporthe angelicae et D. eres : ces champignons sont responsables de grillures d’ombelles et de nécroses de tiges sur carotte porte-graine. Nos recherches actuelles sur cette maladie résurgente visent à une meilleure connaissance du cycle de la maladie, et notamment le déterminisme de la transmission du champignon à la semence [Ménard et al. 2014 ; Bastide et al. soumis]