A propos des cookies

Qu’est-ce qu’un « cookie » ?

Un "cookie" est une suite d'informations, généralement de petite taille et identifié par un nom, qui peut être transmis à votre navigateur par un site web sur lequel vous vous connectez. Votre navigateur web le conservera pendant une certaine durée, et le renverra au serveur web chaque fois que vous vous y re-connecterez.

Différents types de cookies sont déposés sur les sites :

Cookies strictement nécessaires au bon fonctionnement du site
Cookies déposés par des sites tiers pour améliorer l’interactivité du site, pour collecter des statistiques

> En savoir plus sur les cookies et leur fonctionnement

Les différents types de cookies déposés sur ce site

Cookies strictement nécessaires au site pour fonctionner

Ces cookies permettent aux services principaux du site de fonctionner de manière optimale. Vous pouvez techniquement les bloquer en utilisant les paramètres de votre navigateur mais votre expérience sur le site risque d’être dégradée.

Par ailleurs, vous avez la possibilité de vous opposer à l’utilisation des traceurs de mesure d’audience strictement nécessaires au fonctionnement et aux opérations d’administration courante du site web dans la fenêtre de gestion des cookies accessible via le lien situé dans le pied de page du site.

Cookies techniques

Nom du cookie	Finalité	Durée de conservation
Cookies de sessions CAS et PHP	Identifiants de connexion, sécurisation de session	Session
Tarteaucitron	Sauvegarde vos choix en matière de consentement des cookies	12 mois

Cookies de mesure d’audience (AT Internet)

Nom du cookie	Finalité	Durée de conservation
atid	Tracer le parcours du visiteur afin d’établir les statistiques de visites.	13 mois
atuserid	Stocker l'ID anonyme du visiteur qui se lance dès la première visite du site	13 mois
atidvisitor	Recenser les numsites (identifiants unique d'un site) vus par le visiteur et stockage des identifiants du visiteur.	13 mois

À propos de l’outil de mesure d’audience AT Internet :

L’outil de mesure d’audience Analytics d’AT Internet est déployé sur ce site afin d’obtenir des informations sur la navigation des visiteurs et d’en améliorer l’usage.

L‘autorité française de protection des données (CNIL) a accordé une exemption au cookie Web Analytics d’AT Internet. Cet outil est ainsi dispensé du recueil du consentement de l’internaute en ce qui concerne le dépôt des cookies analytics. Cependant vous pouvez refuser le dépôt de ces cookies via le panneau de gestion des cookies.

À savoir :

Les données collectées ne sont pas recoupées avec d’autres traitements
Le cookie déposé sert uniquement à la production de statistiques anonymes
Le cookie ne permet pas de suivre la navigation de l’internaute sur d’autres sites.

Cookies tiers destinés à améliorer l’interactivité du site

Ce site s’appuie sur certains services fournis par des tiers qui permettent :

de proposer des contenus interactifs ;
d’améliorer la convivialité et de faciliter le partage de contenu sur les réseaux sociaux ;
de visionner directement sur notre site des vidéos et présentations animées ;
de protéger les entrées des formulaires contre les robots ;
de surveiller les performances du site.

Ces tiers collecteront et utiliseront vos données de navigation pour des finalités qui leur sont propres.

Accepter ou refuser les cookies : comment faire ?

Lorsque vous débutez votre navigation sur un site eZpublish, l’apparition du bandeau « cookies » vous permet d’accepter ou de refuser tous les cookies que nous utilisons. Ce bandeau s’affichera tant que vous n’aurez pas effectué de choix même si vous naviguez sur une autre page du site.

Vous pouvez modifier vos choix à tout moment en cliquant sur le lien « Gestion des cookies ».

Vous pouvez gérer ces cookies au niveau de votre navigateur. Voici les procédures à suivre :

Firefox ; Chrome ; Explorer ; Safari ; Opera

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de INRAE par email à cil-dpo@inrae.fr ou par courrier à :

INRAE
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

Thèse de Sabrina Macé (2010-2013)

Caractérisation et quantification moléculaires de l’écosystème microbien d’altération du saumon cru et des crevettes cuites

Résumé :

Le saumon frais et les crevettes cuites commercialisés dans la grande distribution sont souvent présentés sous forme de portions conditionnées sous vide ou sous atmosphère enrichie en CO2. Cette atmosphère protectrice inhibe la croissance de certaines bactéries, cependant, d’autres bactéries tolérantes au CO2 vont dominer le microbiote d’altération de ces produits. L’objectif de cette thèse a été d’approfondir la connaissance de la flore à l’origine de leur altération.
La description de l’écosystème microbien d’altération des pavés de saumon et des crevettes tropicales cuites a été réalisée à l’aide de méthodes microbiologiques traditionnelles et moléculaires comme la PCR-TTGE et le pyroséquençage. Les bactéries lactiques, notamment Lactococcus piscium, Carnobacterium maltaromaticum, Carnobacterium divergens, Lactobacillus sakei ainsi que des bactéries à Gram négatif comme Photobacterium phosphoreum et des entérobactéries (Serratia spp.) ont été considérées comme groupes bactériens dominants au moment de l’altération du saumon cru sous atmosphère protectrice par ces deux types de méthodes. Shewanella baltica et C. maltaromaticum étaient les bactéries majoritairement présentes dans les crevettes tropicales cuites entières altérées alors que les bactéries lactiques comme Carnobacterium spp., Leuconostoc spp. et Streptococcus parauberis constituaient le groupe bactérien dominant des crevettes tropicales cuites décortiquées altérées analysées par pyroséquençage. Afin d’identifier les bactéries responsables de l’altération de ces produits, le potentiel d’altération de plusieurs de ces espèces a été étudié en réalisant des inoculations sur produits stériles. L’altération de ces échantillons a ensuite été caractérisée grâce à une combinaison de méthodes sensorielles, chimiques, microbiologiques et moléculaires. L’analyse des composés volatils par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS) a également été réalisée pour certains échantillons. C. maltaromaticum et S. baltica sont toutes deux impliquées dans l’altération des crevettes tropicales entières cuites et P. phosphoreum s’est révélée être la bactérie responsable de l’altération du saumon cru sous atmosphère protectrice.
Aucune méthode classique de quantification spécifique de P. phosphoreum n’étant disponible, une méthode de PCR en temps-réel combinée à un traitement préalable des échantillons au propidium monoazide (PMA) a ensuite été développée et appliquée avec succès, dans le but de dénombrer les cellules viables de cette bactérie dans des échantillons de saumon cru.

Valorisation :

Macé, S., J. Cornet, F. Chevalier, M. Cardinal, M. F. Pilet, D. X. and J. J. Joffraud 2012. Characterisation of the spoilage microbiota in raw salmon (Salmo salar) steaks stored under vacuum or modified atmosphere packaging combining conventional methods and PCR-TTGE. Food Microbiology 30(1): 8. Ranking du JCR: Q1.
Mamlouk, K., S. Macé, M. Guilbaud, E. Jaffrès, M. Ferchichi, H. Prévost, M.-F. Pilet and X. Dousset 2012. Quantification of viable Brochothrix thermosphacta in cooked shrimp and salmon by real-time PCR. Food Microbiology 30(1): 173-179. Ranking du JCR: Q1.
Macé, S., J.-J. Joffraud, M. Cardinal, M. Malcheva, J. Cornet, V. Lalanne, F. Chevalier, T. Sérot, M.-F. Pilet and X. Dousset 2013. Evaluation of the spoilage potential of bacteria isolated from spoiled raw salmon (Salmo salar) fillets stored under modified atmosphere packaging. International Journal of Food Microbiology 160(3): 227-238. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2012.10.013. Ranking du JCR: Q1.
Macé, S., K. Mamlouk, S. Chipchakova, H. Prévost, J.-J. Joffraud, P. Dalgaard, M.-F. Pilet and X. Dousset 2013. Development of a Rapid Real-Time PCR Method as a Tool To Quantify Viable Photobacterium phosphoreum Bacteria in Salmon (Salmo salar) Steaks. Applied and Environmental Microbiology 79(8): 2612-2619. 10.1128/aem.03677-12. Ranking du JCR: Q1.
Mace, S., M. Cardinal, E. Jaffres, J. Cornet, V. Lalanne, F. Chevalier, T. Serot, M.-F. Pilet, X. Dousset and J.-J. Joffraud 2014. Evaluation of the spoilage potential of bacteria isolated from spoiled cooked whole tropical shrimp (Penaeus vannamei) stored under modified atmosphere packaging. Food Microbiology 40: 9-17. 10.1016/j.fm.2013.11.018. Ranking du JCR: Q1.
Chaillou, S., A. Chaulot-Talmon, H. Caekebeke, M. Cardinal, S. Christieans, C. Denis, M. Helene Desmonts, X. Dousset, C. Feurer, E. Hamon, J.-J. Joffraud, S. La Carbona, F. Leroi, S. Leroy, S. Lorre, S. Mace, M.-F. Pilet, H. Prevost, M. Rivollier, D. Roux, R. Talon, M. Zagorec and M.-C. Champomier-Verges 2015. Origin and ecological selection of core and food-specific bacterial communities associated with meat and seafood spoilage. ISME Journal(9): 1105-1118. https://doi.org/10.1038/ismej.2014.202. Ranking du JCR: Q1.
Macé, S., N. Haddad, M. Zagorec and O. Tresse 2015. Influence of measurement and control of microaerobic gaseous atmospheres in methods for Campylobacter growth studies. Food Microbiology 52: 169-176. http://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2015.07.014. Ranking du JCR: Q1.
Jérôme, M., S. Macé, X. Dousset, B. Pot and J.-J. Joffraud 2016. Genetic diversity analysis of isolates belonging to the Photobacterium phosphoreum species group collected from salmon products using AFLP fingerprinting. International Journal of Food Microbiology 217: 101-109. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.10.018. Ranking du JCR: Q1.